Το καύσιμο ντίζελ μπορεί εύκολα να μολυνθεί από το νερό επειδή το καύσιμο ντίζελ απορροφά νερό περισσότερο από τη βενζίνη. Για το λόγο αυτό, πολλά πετρελαιοκίνητα οχήματα διαθέτουν ένα gadget που ονομάζεται διαχωριστής νερού που συλλέγει νερό από το καύσιμο. Συνήθως βρίσκεται πάνω ή κοντά στο φίλτρο καυσίμου. Εάν το όχημά σας δεν έχει, μπορείτε να το εγκαταστήσετε. Το εξάρτημα δεν πρέπει να είναι τρομερά ακριβό και μπορεί να σας εξοικονομήσει πολλά χρήματα για επισκευές.
Αν και μερικοί διαχωριστές νερού είναι αυτοκαθαριζόμενοι, οι περισσότεροι πρέπει να αποστραγγίζονται χειροκίνητα: Απλώς στρίβετε μια μικρή βαλβίδα αποστράγγισης που ονομάζεται petcock και αδειάζετε το νερό από το θάλαμο συλλογής του διαχωριστή.
Είναι καλή ιδέα να ελέγχετε αρχικά τον διαχωριστή νερού εβδομαδιαίως για να δείτε πόσο γρήγορα γεμίζει υπό κανονικές συνθήκες όταν οδηγείτε με καύσιμο από τη συνήθη πηγή σας. Εάν το καύσιμο περιέχει πολύ νερό, ίσως θελήσετε να εξετάσετε το ενδεχόμενο αγοράς καυσίμου από αλλού.